qu' entends tu par "fusionner"?
Si ce n' est pas les fondre l' un dans l' autre, il existe une solution.
Par exemple tu as téléchargé un thème qui te plais et tu aimerais y ajouter tes propres modifications.
Dans ce cas là, tu utilises le système du thème enfant: dans le dossier des thème se trouve déjà celui de départ et tu en crées un nouveau que tu déclare "enfant" du premier. Pour la formule magique, voir le codex de wordpress. De cette manière, tu peux modifier le premier.
Mais attention, ce système a quelques inconvénients.