Dans ton fichier ~/.bashrc (ctrl+h dans ton dossier personnel) tu l'ouvres avec gedit (ou autres) et normalement il y a plusieurs ligne ou il est écrit
export PATH=$PATH: ...
et la tu rajoutes le dossier après les derniers ":".
exemple :
export PATH=$PATH:/home/user/cakephp/lib/Cake/Console/
Et normalement tu peux utiliser le cake bake.