Salut,
Non pas d'organisation magique, en dehors de rails c'est à toi de gérer ton arborescence.
pour les petits projets tu peux tout mettre dans le même dossier, sinon utilises une arborescence similaire à Rails, par exemple:
un dossier pour les models, un dossier pour une feature, une section de ton projet, un autre dossier pour une autre feature ou section etc, etc.