Salut,
J'ai déjà fait un peu de parallaxe pour un site. J'ai utilisé jQuery pour récupérer la valeur du scroll est modifier la position top des images. J'ai aussi joué sur les z-index pour les effets de superposition.
Muse je ne connais pas beacoup mais visiblement c'est possible, il y a plein de tutos (en anglais par contre) qui expliquent comment faire du parallaxe avec Muse. J'ai trouvé celui-là qui a l'avantage d'être en français http://youtu.be/Ls4ppYVFS5M. Il faudra l'adapter un minimum en fonction de ce que tu veux faire, mais je pense que c'est jouable.
Bon courage !
MaxSliw