Suppression d'un élément dans une collection

Bonjour,

J'utilise Symfony 3.4.7 .
Je travaille avec trois entités,articles, catégories, articles_categories qui fait le lien entre un article et une catégorie.
Pour gérer un article et ses relations articles_catégories, j'utilise la classe CollectionType que j'ajoute dans le formulaire ArticlesType.
Dans mon affichage je gère l'ajout d'une relation et sa suppression.
Voici le code de mon entité articles :

/**
 * Articles
 *
 * @ORM\Table(name="articles")
 * @ORM\Entity(repositoryClass="AppBundle\Repository\ArticlesRepository")
 * @UniqueEntity("codeArticle", message="Déjà utilisé")
 */
class Articles
{

    public function __construct()
    {
        $this->articlesCategories = new ArrayCollection();
    }

    /**
     * @var string
     *
     * @ORM\Column(name="code_article", type="string", length=10)
     * @ORM\Id
     */
    private $codeArticle;

    //... autres variables

    /**
     * @var ArticlesCategories
     *
     * @ORM\OneToMany(targetEntity="AppBundle\Entity\ArticlesCategories", mappedBy="codeArticle", cascade={"persist", "remove"}, orphanRemoval=true)
     */
    private $articlesCategories;

    // autres getters et setters 

    /**
     * Add articlesCategorie
     *
     * @param ArticlesCategories $articleCategorie
     *
     * @return Articles
     */
    public function addArticlesCategorie(ArticlesCategories $articleCategorie){
        $this->articlesCategories[] = $articleCategorie;
        $articleCategorie->setCodeArticle($this);

        return $this;
    }

    /**
     * remove articlesCategorie
     *
     * @param ArticlesCategories $articlesCategorie
     */
    public function removeArticlesCategorie(ArticlesCategories $articlesCategorie){
        $this->articlesCategories->removeElement($articlesCategorie);
    }

    public function setArticlesCategories($articlesCategories){
        $this->articlesCategories = $articlesCategories;
        return $this;
    }

    /**
     * Get articlesCategories
     *
     * @return Collection
     */
    public function getArticlesCategories(){
        return $this->articlesCategories;
    }
 }

Voici le code de mon entité articlesCatégories :

/**
 * ArticlesCategories
 *
 * @ORM\Table(name="articles_categories", uniqueConstraints={@ORM\UniqueConstraint(name="unique_codeArticle_codeCategorie", columns={"code_article_id", "code_categorie_id"})})
 * @ORM\Entity(repositoryClass="AppBundle\Repository\ArticlesCategoriesRepository")
 * @UniqueEntity(fields={"codeArticle", "codeCategorie"}, message="Cette relation est déjà enregistré")
 */
class ArticlesCategories
{
    /**
     * @var int
     *
     * @ORM\Column(name="id", type="integer")
     * @ORM\Id
     * @ORM\GeneratedValue(strategy="AUTO")
     */
    private $id;

    /**
     * @var string
     *
     * @ORM\ManyToOne(targetEntity="AppBundle\Entity\Articles", inversedBy="articlesCategories", cascade={"remove"})
     * @ORM\JoinColumn(referencedColumnName="code_article", nullable=false)
     */
    private $codeArticle;

    /**
     * @var string
     *
     * @ORM\ManyToOne(targetEntity="AppBundle\Entity\Categories", cascade={"remove"})
     * @ORM\JoinColumn(referencedColumnName="reference", nullable=false)
     */
    private $codeCategorie;

    /**
     * @var string
     *
     * @ORM\Column(name="critere_rech_1", type="string", length=45, nullable=true)
     */
    private $critereRech1;

    //... getters et setters
 }

Voici le code de mon formuaire ArticlesType.php :

class ArticlesType extends AbstractType
    {
        /**
         * {@inheritdoc}
         */
        public function buildForm(FormBuilderInterface $builder, array $options)
        {
            $builder
                ->add('codeArticle')
                //...autres attributs
                ->add('articlesCategories', CollectionType::class, array(
                    'entry_type' => ArticlesCategoriesType::class,
                    'allow_add' => true,
                    'allow_delete' => true,
                    'prototype' => true,
                    'label' => 'categories',
                    'attr' => array('class' => 'collection-articlesCategories'),
                    'auto_initialize' => true,
                    'by_reference' => false
                ));
        }
     }

Voici l'action que j'appelle quand je veux éditer un article :

class ArticlesController extends Controller
{
/**
     * Displays a form to edit an existing article entity.
     *
     * @Route("/edit/{codeArticle}", name="articles_edit", defaults={"codeArticle" = null} )
     * @Method({"GET", "POST"})
     */
    public function editAction(Request $request, Articles $article = null)
    {
        if($article != null){
            /*$em = $this->getDoctrine()->getManager();
            $article = $em->getRepository('AppBundle:Articles')->find($id_article);*/
            $deleteForm = $this->createDeleteForm($article);
            $editForm = $this->createForm('AppBundle\Form\ArticlesType', $article);
            $editForm->handleRequest($request);

            if ($editForm->isSubmitted() && $editForm->isValid()) {
                // récupère tous les articles même ceux qui viennent d'être ajouter par la fonction JS add
                $articlesCategories = $article->getArticlesCategories();
                dump($articlesCategories);
                foreach($articlesCategories as $ac){
                    // si l'article est null
                    if($ac->getCodeArticle() == null){
                        // on attribue à la relation articleCategorie l'article que l'on modifi
                        $ac->setCodeArticle($article);
                    }

                }
                $this->getDoctrine()->getManager()->flush();
            }

            return $this->render('articles/edit.html.twig', array(
                'article' => $article,
                'edit_form' => $editForm->createView(),
                'delete_form' => $deleteForm->createView(),
            ));
        }
        else{
            return $this->forward('AppBundle:articles:new', [
                    'message' => 'Pour éditer un article il faut d\'abord l\'afficher.'
                ]
            );
        }
    }
  }

L'affichage se fait sur une vue twig. Et j'utilise jquery pour ajouter et enlever du formulaire une relation articlesCategories.

Le problème que je rencontre c'est, lorsque j'ajoute une relation et que je clique sur "Editer", je peux constater que dans ma base de donées il y a bien une relation qui a été créée. Cependant lorsque je supprime une relation et que je clique sur "Editer", je constate que la suppression de mon entité ne s'est pas réalisée dans ma base de données.
Je n'arrive pas à voir où est mon erreur, ou si cette réaction est normale.

J'espère avoir été assez claire, Je vous remercie de votre future aide !